本作还有一些不错的改良点,例如过去想要确认精灵的个体值,都要找NPC对话来一只只判断,但是现在只要孵化二十颗以上的蛋,就可以到「对战树」门口的NPC开启评定功能,之后就能直接在存放精灵的电脑里面直接检视个体值,对于想要认真培养及对战的玩家是一大福音。
个体值不理想的精灵在本作中有「极限特训」可以补救,使用「金色王冠」可将所有能力提升到极限,「银色王冠」则是将单一能力提升到极限。不过虽然得知「金色王冠」可以在游戏中得到,但可能无法大量获得,且需要将精灵练到一百级才能使用,所以想要大量取得满个体值(6V)的精灵,还是要靠传统的生蛋培育比较有效率。
此外,极限特训提升的个体值无法遗传,遗传看的还是原始的数据,所以不用想把专门用来繁殖的百变怪拿去特训,因为这样也无法量产满个体值的精灵。(百变怪:害怕~~)
在「对战树」中可以遇到令人熟悉的角色,虽然可能因为岁月的关系,跟以前长得不太一样。
战斗场景比以前更丰富,而且对战时终于可以看到双方的训练师,不再只是单纯的图片。
野生的精灵会呼唤伙伴参战,除了提升游戏难度外,有机会出现平时遇不到的精灵。而且在单场战斗不断累积呼唤次数,可以遇到个体更好,以及拥有隐藏特性(梦特性)的精灵,闪光精灵出现的机率也比一般更高。如果要提升呼唤的机率,可以使用在商店买得到的「胆怯球」。不过呼唤不见得总是成功,有时野生精灵叫半天也唤不到同伴,让人有点不耐烦。